Το Τμήμα αντιμετωπίζει παθήσεις του Κεντρικού Νευρικού Συστήματος, δηλαδή του εγκεφάλου και του νωτιαίου μυελού. Σε αυτές περιλαμβάνονται συγγενείς ανωμαλίες διαπλάσεως (π.χ. δισχιδής ράχη, υδροκέφαλος), οι οποίες συχνά διαγιγνώσκονται τους πρώτους μήνες της ζωής, όγκοι εγκεφάλου και νωτιαίου μυελού, τραυματισμοί και ένα φάσμα άλλων παθήσεων που μπορούν να προσβάλουν το νευρικό σύστημα και χρειάζονται χειρουργική θεραπεία. Επίσης, χρησιμοποιεί τεχνολογικά προηγμένο χειρουργικό εξοπλισμό και πραγματοποιεί νευροχειρουργικές επεμβάσεις σε παιδιά από τη νεογνική έως και την εφηβική ηλικία. Το Νευροχειρουργικό τμήμα αντιμετωπίζει όλο το φάσμα των παιδο-νευροχειρουργικών επεμβάσεων και εξειδικεύεται σε νευροενδοσκοπήσεις, χειρουργική αντιμετώπιση της σπαστικότητας, χειρουργική όγκων του εγκεφάλου με χρήση νευροπλοηγήσεως, χειρουργική συγγενών κρανιο-προσωπικών παθήσεων, χειρουργική αντιμετώπιση της επιληψίας με χρήση διεγχειρητικού ηλεκτροεγκεφαλογραφήματος και έχει την υποστήριξη της μονάδας εντατικής θεραπείας του νοσοκομείου.

Το τμήμα προσφέρει νευροχειρουργική κάλυψη σε εσωτερικούς και εξωτερικούς ασθενείς επί 24ωρου βάσεως.